故事出自連拍三集的《倩女幽魂》，徐克二維人物動(dòng)作結(jié)合三維背景電腦處理，成為卡通漫畫版。電影制作歷時(shí)四年，糅合了日本動(dòng)畫和中國(guó)傳統(tǒng)中國(guó)板畫風(fēng)格。
　　寧采臣（林海峰 配音）在鬼城郭北縣遇上了一個(gè)令他一見(jiàn)鐘情的女鬼小倩（袁詠儀 配音），可惜小倩只想吸取寧的陽(yáng)氣給姥姥（陳慧琳 配音），卻意外地救了寧一命。這時(shí)道士燕赤霞（黃沾 配音）來(lái)到，鬼怪們逃命，寧舍命救了小倩。為免小倩為難，自愿與小倩去見(jiàn)姥姥。當(dāng)姥姥要吸寧的陽(yáng)氣時(shí)，小倩改變了初衷，救了寧。寧與小倩海誓山盟，愿來(lái)世再續(xù)緣。當(dāng)他們投胎時(shí)，遇到了來(lái)報(bào)復(fù)的黑山老妖，后來(lái)被跟來(lái)的燕殺死。但是以掃除一切妖魔鬼怪為目標(biāo)捉鬼大師白云（黃敏民 配音）和十方（葛民輝 配音）卻要消滅所有投胎的妖怪，燕不得不與他們斗法，最后兩敗俱傷。經(jīng)歷了種種磨練，寧終于得以與小倩重逢，再也不分離……