繼續(xù)延續(xù)上一季的劇情，原來穆德受了騙，及時(shí)發(fā)覺錯(cuò)誤后和史考莉串通好來騙政府高層，以潛入一個(gè)“作為一個(gè)普通FBI特別探員不該進(jìn)入的地方”搜集需要的資料。本季發(fā)展越來越精彩，一些沒有被完全改造的混血外星人聯(lián)合起來抵抗殖民陰謀。史考莉被綁架時(shí)子宮被移除，但今年卻出現(xiàn)了她的孩子——艾蜜莉。今年制作小組甚至找了兩位知名科幻小說家操筆，客串寫出兩集劇本。另外今年也有一集喜劇。整出X檔案為了配合電影的上映，加入了一些角色及內(nèi)容，“辛迪加”組織的陰謀越來越明顯，穆德再一次接近事實(shí)的真相。穆德前女友的出現(xiàn)也對(duì)穆德與史考莉間的關(guān)系做出重大考驗(yàn)。該季結(jié)束于吸煙人燒毀了所有X檔案卷宗。
尼爾·哈德森 阿曼達(dá)·哈爾 阿道·歐漢隆 艾略特·科萬 唐·沃靈頓 薩繆爾·韋斯特 亞德里安·埃德蒙松 妮娜·瓦迪婭 Shyko Amos Aude Legastelois Tobi Bakare Alex Gaumond
奧利維婭·科爾曼 托比亞斯·門基斯 海倫娜·伯翰·卡特 喬什·奧康納 本·丹尼爾斯 查爾斯·丹斯 科林·摩根 德里克·雅各比 杰拉丁·卓別林 埃默拉爾德·芬內(nèi)爾 杰森·沃特金斯 查爾斯·愛德華茲 瑪麗昂·貝利 哈里·崔德威 米哈伊爾高里沃 皮普·托倫斯 薩克·霍蘭 史蒂芬·薩姆森 約翰·霍林沃思
加布里埃爾·伯恩 查爾斯·丹斯 斯蒂芬·迪蘭 薩米·蓋爾 魯珀特·格雷夫斯 拉爾夫·伊內(nèi)森 Russell Kilmister Sylvestra Le Touzel Anna Madeley Gina McKee Ruth Negga Jamie Sives Al Weaver
約翰·卡拉辛斯基 維德爾·皮爾斯 約翰·胡熱那克 艾比·考尼什 阿里·蘇萊曼 迪納·什瓦比 哈斯·塞雷曼 卡里姆·蔡因 埃曼紐爾·盧西爾·馬丁內(nèi)斯 約翰·艾德坡 弗朗西斯科·丹尼斯 詹迪·莫拉 克麗絲蒂娜·烏瑪尼亞 戈蘭·卡斯蒂克 梅納·瑪索德 大衛(wèi)·諾羅納 瑪麗-喬西·克羅茲 蒂莫西·赫頓 丹尼爾·卡什