創(chuàng)圣紀(jì)0011年的地球，由于11年前的大異變，人類喪失了2/3的人口。
南極冰山溶化，1萬2千年前滅亡的亞特蘭蒂亞重現(xiàn)于世，擁有雙翼的「墮天翅族」蘇醒了。他們將生物機(jī)械兵器「神話獸」接連送入人類的都市，捕獲人類，攝取生體能源「Purana」。
另一方面，人類決心反擊，從海底遺跡發(fā)掘?qū)缛_(tái)組合（hybrid）戰(zhàn)斗機(jī)「Vector Machine」。這是1萬2千年前，將墮天翅族逼入滅亡絕境的傳說中的兵器。Vector Machine經(jīng)過合體，「機(jī)械天使Aquarion」即將現(xiàn)身。
要啟動(dòng)Aquarion，需要能與機(jī)體的機(jī)械生命感應(yīng)和共鳴，稱為「Element」的人。這要求特別敏銳的五感和純真的靈魂，因此十五歲左右的少年少女們被選為機(jī)師，集中起來。
而后，「機(jī)械天使Aquarion」合體的時(shí)刻終于到來…
內(nèi)田雄馬 戶谷菊之介 石見舞菜香 內(nèi)田真禮 本渡楓 井上和彥 田丸篤志 竹內(nèi)良太 齋賀光希 松岡禎丞 桑原由氣 茅野愛衣 田中正彥
難波圭一 冬馬由美 若本規(guī)夫 鄉(xiāng)里大輔 榊原良子 石冢運(yùn)升 鈴木沙織 浦和惠 里內(nèi)信夫 增田有宏 川津泰彥 沼田祐介 內(nèi)海秀雄 小川真司