故事發(fā)生在名為恩典農場的孤兒院內，在這里生活著很多失去了親人，無家可歸的孩子們，他們共有36人，每天，在勞作和玩耍之余，孩子們還要進行學習和測驗，其中，佼佼者是名為艾瑪（諸星堇 配音）的女孩和名為諾曼（內田真禮 配音）的男孩。負責管理和看護這些孩子們的女性名叫伊莎貝拉（甲斐田裕子 配音），孩子們喜歡喊她“媽媽”。每過一段時間，都會有一個孩子被收養(yǎng)離開農場，生活在這里的孩子們都將此作為自己的人生目標。
一次偶然中，艾瑪發(fā)現(xiàn)了隱藏在這座孤兒院背后的秘密，那些離開的孩子根本就沒有被領養(yǎng)，而是被屠宰了，生活在恩典農場的孩子們，其實就是這座農場所飼養(yǎng)的“牲畜”。
