“闇之書事件”（參照魔法少女奈葉A's）的10年后。踏入19歳的高町奈葉、菲特·T·哈洛溫、八神疾風三人，懷抱著彼此的友情牽絆、為了追求各自的夢想實現(xiàn)而加入時空管理局，并以一流魔導(dǎo)師的身分活躍。
在此當中，出現(xiàn)了新發(fā)現(xiàn)的太古遺產(chǎn)“圣遺晶石”（レリック），以及以此為目標而出現(xiàn)的謎樣機械兵器“共鳴拓發(fā)者”（ガジェットドローン）。為了迅速對應(yīng)日后被稱為“圣遺晶石事件”的狀況，八神疾風考慮到設(shè)置能夠迅速對應(yīng)的獨立部隊的必要性，設(shè)立了專責處理與太古遺產(chǎn)關(guān)連任務(wù)的特殊部隊——“機動六課”。
另一邊，時間回溯到四年前。昴·中島在遭到機場火災(zāi)卷入而幾乎喪命之際，由于奈葉的出現(xiàn)而得救。因為憧憬著如同“自己理想中的形象”一般的奈葉，昴在當晚的滿天星空之下，做出了“成為管理局的魔導(dǎo)師”的決定。
四年后，經(jīng)過一番波折而順利成為管理局的新進魔導(dǎo)師的昴，與訓(xùn)練校時代的伙伴蒂雅娜·蘭斯特共同挑戰(zhàn)魔導(dǎo)師的升格試驗。于遠處凝視著兩人考試的，分別是認定兩人將成為“機動六課”的明日之星而投以注意的疾風與菲特、還有奈葉。在三人的注視之中，隨著宣告試驗開始的ReinForce II（統(tǒng)御之力zwei）的聲音，拉開了“StrikerS”故事的序幕。
小野賢章 櫻井孝宏 古川慎 中村悠一 大橋賢一郎 細谷佳正 島崎信長 日笠陽子 浪川大輔 前野智昭 岡本信彥 鳥海浩輔 山下大輝 柳田淳一 高梨謙吾 津田英三 平川大輔 南條愛乃 諏訪部順一 森久保祥太郎 清川元夢 羽多野涉 內(nèi)田雄馬 逢坂良太 天崎滉平 濱野大輝 村田太志 小野大輔 內(nèi)匠靖明 堀秀行 川田紳司 松岡禎丞 飛田展男
加隈亞衣 久野美咲 佐倉綾音 川澄綾子 茅野愛衣 高橋未奈美 赤崎千夏 大西沙織 瀨戶麻沙美 釘宮理惠 杜野真子 新井里美 石谷春貴 久保田民繪 小林裕介 巽悠衣子 種田梨沙
田中真弓 岡村明美 中井和哉 山口勝平 平田廣明 伊倉一惠 山口由里子 京田尚子 青野武 藤本隆弘 粕谷雄太 柴崎幸一 坂元奈月 鹿野優(yōu)以 日比愛子 中尾良平 金子英彥 森岳志 三宅淳一 藤川奈彌 藤川由記 加藤浩次 山本圭壹 稻垣吾郎
水田山葵 大原惠美 嘉數(shù)由美 木村昴 關(guān)智一 三石琴乃 藤本千秋 龍?zhí)镏睒?nbsp;松本幸 三瓶由布子 堀江由衣 愛河里花子 土師孝也 石井康嗣 川村萬梨阿 高戶靖廣 飯?zhí)锢?nbsp;寺崎貴司 浦川泰幸 宮本啟丞 小松靖 林和人 上山千穗 島本真衣 鈴木詩織 千葉繁 松平健 向井理
保志總一朗 井上喜久子 高田由美 興梠里美 川澄綾子 田村由香里 大原沙耶香 西村千奈美 巖田光央 三浦祥朗 內(nèi)田直哉 佐久間玲 南央美 金田朋子 江原正士 仲野裕 杉田智和